Po izpadu iz slovenske lige in reorganizaciji tekmovanja je Sobota v sezoni 1947/48 tekmovala v II. skupini slovenske nogometne lige kjer so tekmovali še Udarnik Kranj, Jože Gregorčič, Gorica, Litija, Škofja Loka, Postojna in Elan iz Novega mesta. Sobočani, ki so po jesenskem delu zasedli tretje mesto so spomladi zmagali vse tekme in se znova uvrstili v najvišji rang slovenskega nogometa. Nogometaši so zraven prvenstvenih tekem igrali še v pokalu Federativne ljudske republike Jugoslavije (FLRJ) in izpadli v slovenskem polfinalu proti ljubljanskemu Krimu. Sobočani so odigrali še precej prijateljskih tekem. Najbolj je odmevala zmaga nad zagrebško Mladostjo, ki so jo na Fazaneriji premagali s 4:1. Zraven prve je imela Sobota še drugo ekipo, ki je tekmovala v mariborskem okrožnem prvenstvu in prav tako zasedla prvo mesto. Tekme sta igrali še mladinska in pionirska ekipa.
Po menjavi generacije, ki se je zgodila po koncu vojne se je ekipa počasi stabilizirala. Igrali so: Mirko Babič, Bavčar, Franc Bencik, Cvetič, Janez Horvat, Ciril Klajnšček, Stanko Klepec, Feri Kološa, Franc Kološa, Ludvik Norčič ml., Štefan Aki Norčič, Janez Sečko, Jurij Vrtarič, Feri Zelko in Žižek.
Predsednik FD Sobote je še naprej ostal Milan Šušterič. Pod okriljem društva pa so delovale tudi ostale športne panoge kot sta šah in košarka. Društvo je pripravilo več različnih prireditev. Prvega junija 1947 je na stadionu potekal fizkuluturni dan, na katerem so se nogometaši pomerili z ekipo Jugoslovanske armade. Organizirali so več šahovskih turnirjev, turnirjev v košarki in krosu. Člani društva so tekmovali tudi za fizkulturne znake, ki so jih oktobra 1947 svečano podelili na stadionu v Fazaneriji. FD Sobota je imela v letu 1947 650 članov in je veljala za eno izmed najagilnejših podeželskih društev.
