V sezoni 2020/2021 je Mura tekmovala v 1. SNL in prvič v zgodovini samostojne Slovenije osvojila naslov državnega prvaka. Osvojila je 63 točk, na zadnji tekmi prvenstva pa je v Mariboru slavila z 1:3. V pokalnem tekmovanju je Mura izpadla že v prvi tekmi proti Dravi in ni uspela ubraniti naslov pokalnega zmagovalca. Črno-beli so velik uspeh dosegli v kvalifikacijah za Ligo Europa. V prvem predkrogu so premagali Nomme Kalju, v drugem Aarhus, v tretjem pa so na Fazaneriji izgubili z nizozemskim PSV-jem. Sezono je zaznamoval koronavirus, zato so tekme večinoma potekale brez prisotnosti gledalcev. Z osvojitvijo naslova državnih prvakov so si črno-beli prvič v zgodovini priigrali nastop v kvalifikacijah za Ligo prvakov.
Trener ekipe je bil Ante Šimundža, za Muro pa so igrali: Aljaž Antolin, Luka Bobičanec, Marko Brkić, kai Cipot, Tio Cipot, David Đurak, Andrija Filipović, Jan Gorenc, Tomi Horvat, Marin Karamarko, Žan Karničnik, Mihael Klepač, Filip Kosi, Žiga Kous, Nino Kouter, Alen Kozar, Dragan Lovrić, Staniša Mandić, Luka Marič, Amadej Maroša, Matic Maruško, Matko Obradović, Samsindin Ouro, Klemen Pucko, Vito Štrakl, Klemen Šturm, Jure Travner, Marko Zalokar in Kevin Žižek. Matko Obradović, Luka Bobičanec in Žan Karničnik so bili po mnenju sindikata profesionalnih igralcev nogometa izbrani v najboljšo enajsterico SNL. Zimske priprave je Mura opravila v Turčiji.
Predsednik kluba je bil Robert Kuzmič. Ostali člani upravnega odbora so bili: Denis Rajbar (športni direktor in podpredsednik kluba), Boris Cigüt, Štefan Žlebič, Beno Štornik, Stanko Prelec in Damjan Rajh.
Mura je bila zelo aktivna na marketinškem in obnogometnem področju. Pripravila je srečanje z naslovom Pitaj ka ščeš? in organizirala nagradno igro Što san? Sodelovala je s črno-belimi oštarijami v katerih so si navijači lahko ogledovali tekme.
