Vodenje prvega moštva je po vrnitvi med prvoligaše prevzel Robert Pevnik. Po visokem porazu v Mariboru pa ga je v 7. krogu zamenjal prav Mariborčan Ante Šimundža. Ta je povsem prerodil moštvo Mure ter ga s 3. mestom na koncu sezone popeljal do nastopanja v Evropi. V prvem krogu kvalifikacij je Mura izločila azerbajdžanski Baku, v drugem bolgarsko CSKA Sofijo ter v tretjem krogu ukrajinski Arsenal iz Kijeva. Šele v 4. krogu je morala Mura priznati premoč sloviti ekipi rimskega Lazia. V črno-belem dresu je blestel bosanski napadalec Nusmir Fajić, ki je skupno v tej sezoni prvoligaškega tekmovanja dosegel 20 zadetkov.